与肝细胞癌中单细胞/巨相关的瘤预后风险模型基于机器学习和多态学
Xinliang Wan1, Yongchun Zou1, Qichun Zhou1
1Clinical and Basic Research Team of TCM Prevention and Treatment of NSCLC, Department of Oncology, The Second Clinical College of Guangzhou University of Chinese Medicine, Chinese Medicine Guangdong Laboratory, Guangdong Provincial Key Laboratory of Clinical Research on Traditional Chinese Medicine Syndrome, State Key Laboratory of Dampness Syndrome of Chinese Medicine, Guangzhou University of Chinese Medicine, Guangdong Provincial Hospital of Chinese Medicine, Guangzhou, Guangdong, 510120, China.
这项研究使用单细胞/巨细胞基因确定了肝细胞癌 (HCC) 的预后模型. 在HCC中,UQCRH基因预测患者的存活率,耐药性和免疫治疗反应.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 瘤相关巨细胞 (TAMs) 在肝细胞癌 (HCC) 的进展和侵袭中发挥着关键作用.
- 了解单细胞/巨细胞基因表达对于开发HCC的预后工具至关重要.
研究的目的:
- 探索HCC中单细胞/巨细胞相关的基因表达特征.
- 根据这些基因构建和验证基于HCC的预后模型.
- 调查模型与药物耐药性和免疫治疗反应的关系.
主要方法:
- 来自HCC组织的单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 数据被分析以确定标记基因.
- 使用TCGA数据集构建了一个预后模型,并使用Western blot和外部数据集进行验证.
- 进行了空间转录学,药物敏感性和免疫治疗反应分析.
主要成果:
- 开发了一个基于单基因UQCRH的预后模型,将HCC患者分为高风险和低风险组.
- 高的UQCRH表达与降低整体存活率,增加瘤入侵和对索拉芬尼和阿克西替尼的敏感性降低相关.
- 高风险组表现出较差的免疫治疗结果,其特点是APC抑制和较弱的IFN-II反应.
结论:
- 基于UQCRH的预后模型有效预测HCC患者的生存率和治疗结果.
- 该模型识别了具有特定药物敏感性和免疫抑制特征的高风险HCC患者.
- 在HCC中,UQCRH表达与氧化酸化和线粒体功能有关.
更多相关视频
09:53Quantifying the Brain Metastatic Tumor Micro-Environment using an Organ-On-A Chip 3D Model, Machine Learning, and Confocal Tomography
Published on: August 16, 2020
07:32Author Spotlight: Investigating Immune Cell Dynamics in the Tumor Microenvironment — Challenges and Innovations in Cancer Prognosis
Published on: April 12, 2024
