鉴定影响腹腔大动脉动脉瘤炎症和VSMC功能的内细胞网膜压力相关的lncRNAs
Rafael Almendra-Pegueros1, Cristina Rodriguez1,2, Mercedes Camacho1,2
1Institut de Recerca Sant Pau (IR Sant Pau), Barcelona, Spain.
Clinical science (London, England : 1979)
|March 12, 2025
概括
这项研究确定了与腹腔大动脉动脉瘤 (AAA) 中的内质网膜 (ER) 应激相关的新型长非编码RNA (lncRNAs). 这些lncRNAs可能为AAA进展提供新的治疗点.
科学领域:
- 血管生物学 血管生物学
- 分子遗传学 分子遗传学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 腹腔大动脉瘤 (AAA) 是一种危及生命的疾病,药物治疗有限.
- 细胞内膜网膜 (ER) 应激和血管光滑肌细胞 (VSMC) 功能障碍是AAA的关键病理特征.
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 在AAA病变发生中的作用及其与ER压力的联系在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 为了研究在AAA. lncRNA表达的风景.
- 在AAA中识别与ER压力相关的lncRNA.
- 探索这些lncRNAs作为AAA治疗点的潜力.
主要方法:
- 从AAA患者和健康捐赠者的腹腔大动脉进行全基因组转录组分析 (RNA测序).
- 生物信息分析以识别与ER压力相关的差异表达 (DE) lncRNA和mRNA.
- 在大型患者队列和细胞模型中验证DE-lncRNA表达.
- 接收器操作特征 (ROC) 曲线和用于诊断潜力的逻辑回归评估.
- 对mRNA-lncRNA联合表达网络的分析.
主要成果:
- 在AAA中鉴定了6576个DE-mRNA和1283个DE-lncRNA.
- 发现368个与ER应激途径相关的DE-lncRNAs.
- 在AAA患者中验证了关键lncRNAs (例如IL-21-AS1,LINC00626) 的差异表达.
- 证明ER压力会诱导特定的lncRNAs,而治疗剂 (tauroursodeoxycholic acid) 则可以抵消这种效应.
- 确定了参与免疫反应和肌肉收缩的选定lncRNAs和DE-mRNAs之间的相关性.
结论:
- 几种差异表达的lncRNA与AAA中的ER压力有显著的关联.
- 这些与ER压力相关的lncRNA可以将AAA患者与健康个体区分开来.
- 已识别的lncRNAs代表了管理AAA进展的有希望的新型治疗点.
