在中国通过表达序列标签-简单序列重复标记器对黑 (Ribes nigrum) 的遗传多样性评估和核心胚芽查

科学领域:

• 植物遗传学和育种.
• 分子生物学分子生物学
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 黑胡卜 (Ribes nigrum L.) 具有很高的营养价值,但缺乏足够的分子工具用于遗传研究和育种.
• 现有的遗传研究受到黑的有效分子标记物稀缺的阻碍.

研究的目的:

• 识别和表征黑色肋骨的EST-SSR标记物,以促进遗传研究.
• 用新开发的标记物分析Ribes收藏中的遗传多样性.
• 建立核心生殖质组,以实现有效的保护和繁殖计划.

主要方法:

• 从CDS序列中识别了14258个EST-SSR位置.
• 在107个Ribes连接中对228个选定的EST-SSR位点进行PCR放大和凝电泳.
• 对遗传多样性参数的分析,包括等位基因数,异构性和多态信息含量 (PIC).
• 人口结构和邻居结合分析.
• 使用Power Core (PC) 和Core Hunter (CH) 程序识别核心生殖质组.

主要成果:

• 31对EST-SSR标记器产生了清晰可重复的波段.
• 31个标记物表现出显著的多态性,其等位基因数为2-5和PIC值为0.14-0.67.
• 人口结构分析揭示了三个不同的群体,这些群体与地理起源没有严格一致.
• 建立了27个品种的集成核心生殖质组,保留了98.9%的遗传多样性.

结论:

• 开发的EST-SSR标记器为黑的遗传研究,分子育种和遗传学研究提供了宝贵的工具.
• 已建立的核心生殖质组有效地代表了黑胡桃基因库的遗传多样性.
• 这项研究为未来的保护遗传学和Ribes,特别是Ribes nigrum的繁殖努力奠定了基础.