采用自动机器学习 (AutoML) 方法来促进在中的ADMET属性预测
Herim Han1, Bilal Shaker2, Jin Hee Lee3
1NamuICT R&D Center, NamuICT, Seoul 07793, Republic of Korea.
Journal of chemical information and modeling
|March 14, 2025
概括
我们开发了一个人工智能驱动的机器学习模型来预测11个吸收,分布,新陈代谢,分泌和毒性 (ADMET) 属性. 该工具通过改进化合物设计和降低失败率来提高早期药物发现.
科学领域:
- 计算化学的计算化学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 早期药物发现依赖于预测吸收,分布,新陈代谢,分泌和毒性 (ADMET) 特性,以最大限度地减少化合物的消耗.
- 人工智能 (AI) 为*in silico*ADMET建模提供了高通量和具有成本效益的解决方案.
研究的目的:
- 开发和验证使用自动机器学习 (AutoML) 预测11个ADMET属性的机器学习模型.
- 通过使用外部数据集,对这些模型与现有预测工具的性能进行评估.
主要方法:
- 使用Hyperopt-sklearn AutoML方法将40个分类算法与优化的超参数结合起来.
- 开发了11个不同的ADMET属性的预测模型,确保所有模型的ROC曲线下的面积 (AUC) 大于0.8.
主要成果:
- 所有开发的模型都实现了AUC>0.8,这表明预测准确度很高.
- 与已发表的预测模型相比,这些模型对大多数ADMET属性表现出了卓越的性能.
- 在外部数据集上验证时,性能与其他ADMET属性的现有模型可比.
结论:
- 自动机器学习 (AutoML) 是一种可行且有效的方法,用于早期药物发现中的ADMET预测.
- 开发的模型可以帮助研究人员设计具有改进ADMET配置文件的化合物,从而有可能减少晚期药物失败.


