SIGLEC1有可能成为结肠腺癌的免疫相关预后指标:基于转录组数据和孟德尔随机分析的研究
Jue Gu1, Yaxuan Wang2, Hui Zhang2
1Cardiovascular Department Affiliated Hospital of Nantong University, Nantong, China.
Discover oncology
|March 15, 2025
概括
SIGLEC1基因与结肠癌的远程转移有关,影响患者的存活率. 更高的SIGLEC1表达与更严重的疾病和更差的预后相关,提供了新的治疗见解.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 结肠腺癌 (COAD) 是一种流行癌症,瘤微环境 (TME) 显著影响疾病进展.
- 目前对TME在COAD中的作用的理解,特别是关于远程转移的理解,需要进一步阐明.
研究的目的:
- 研究SIGLEC1基因在COAD中远程转移的作用.
- 探索SIGLEC1表达,瘤透性免疫细胞 (TICs) 和COAD中的患者预后之间的相关性.
主要方法:
- 利用癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库对512个COAD病例进行分析,使用CIBERSORT和ESTIMATE分析瘤透免疫细胞 (TICs).
- 对与远程转移 (M 阶段) 相关的差异表达基因 (DEG) 进行了权重基因协同表达网络分析 (WGCNA).
- 进行了基因本体学 (GO),基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富,蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络分析,Cox回归和卡普兰-梅尔生存分析,以确定关键基因及其预后意义.
主要成果:
- 确定了12342个DEG和209个与M阶段相关的关键基因,这些基因在Th1/Th2细胞分化和细胞粘附等途径中富含.
- 通过考克斯回归,PPI网络和生存分析,SIGLEC1被确定为关键基因. 高SIGLEC1表达与免疫相关基因丰富和MYC标相关.
- SIGLEC1与巨细胞和T细胞CD8正相关,这表明它在维持TME免疫主导地位方面发挥了作用. 更高的SIGLEC1表达与更严重的病变和更糟糕的预后有关.
结论:
- SIGLEC1是一种与COAD中远程转移相关的重要基因,影响患者生存预后.
- 这些发现为SIGLEC1在COAD中的作用提供了更深入的理解,并表明它作为治疗点的潜力.
