综合代谢组和转录组分析提供了对 Chuanxiang Black 和 Landrace 猪生殖过程的分子洞察力
Jiangling Li1, Jinling Zhang1, Sujun Zhao1
1Animal Breeding and Genetics Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Animal Science Academy, Chengdu, Sichuan, China.
Frontiers in genetics
|March 17, 2025
概括
转录组和代谢组分析揭示了丸基因表达和Chuanxiang黑猪和Landrace猪之间的代谢物的关键差异. 这些发现突出了circRNA和miRNA在调节男性生殖过程中的作用.
科学领域:
- 生殖生物学 生殖生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 丸功能对于雄性繁殖至关重要,遗传和代谢变异影响猪品种的繁殖表现.
- 了解这些变异需要先进的分析,如转录组学和代谢组学,以确定潜在的分子机制.
研究的目的:
- 为了识别不同表达的基因 (DEGs) 和不同积累的代谢物 (DAMs) 在Chuanxiang黑色和Landrace猪的丸组织.
- 阐明循环RNA (circRNA) 和微RNA (miRNA) 在调节繁殖过程和这些品种之间的基因表达差异中的作用.
主要方法:
- 使用RNA测序对每个品种的六个丸样本进行转录基因分析.
- 通过液态染色体质谱法 (LC-MS) 进行有针对性的代谢分析.
- 生物信息分析包括对DEGs,DAMs,circRNA基因和miRNA的途径丰富.
主要成果:
- 确定了6233个DEG和许多与男性性生殖,精子生殖和性生殖途径相关的DAM.
- 显著丰富的途径包括PI3K-Akt,Rap1,MAPK信号传递和 Chuanxiang黑猪的脂质代谢.
- circRNA和miRNA分析揭示了影响信号通路,内分泌分泌和生殖至关重要的分子相互作用的差异性基因表达.
结论:
- 楚安黑猪和兰德雷斯猪的丸之间存在显著的转录组和代谢组差异,影响生殖途径.
- circRNA和miRNA是男性生殖过程中差异性基因表达的关键调节者.
- 这些发现为特定品种的生殖表现和改善的潜在目标提供了分子洞察力.
