鼠类下丘脑和不确定区域的化学架构研究.Chemopleth 1.0 - 一个可下载的交互式脑图空间数据库,包含五个可共可视化的神经化学系统,具有新的特征和基于网格的绘图工具

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 神经解剖学是一个神经解剖学.
• 计算生物学 计算生物学

背景情况:

• 大鼠的下丘脑和不确定的区域含有重要的神经元群体,但它们作为系统的结构组织尚未得到充分理解.
• 对于使用基因编辑技术和病毒载体介导操纵的功能性审讯,需要精确地绘制大鼠下丘脑神经化学细胞类型的空间地图.

研究的目的:

• 为了介绍Chemopleth 1.0,一个用于大鼠下丘脑 (HY) 和不确定的区域 (ZI) 的化学架构数据库.
• 提供可下载的互动地图,详细说明五个关键神经化学系统的分布.
• 为提供可视化和分析神经化学分布的工具,在大脑地图4.0 (BM4.0) 图谱内.

主要方法:

• 开发了Chemopleth 1.0数据库,其中包括五种免疫反应性神经化学系统的普查分布 (血压素,神经元氧化合成酶,低素1/素A,黑色素缩激素,α-黑色素细胞刺激激素).
• 格式化地图用于开放访问的BM4.0大鼠大脑地图,保留立体坐标以准确定位.
• 创建了基于Python的开放访问工具,以生成来自多个受试者的神经化学分布的异构和合构热图.
• 引入了改进的基于网格的坐标系统,以及用于空间注释的引用立体测量 (FMRS) 的频率映射.

主要成果:

• 为老鼠HY和ZI生成了高空间分辨率的化学架构图.
• 数据库包括可下载的交互式地图,其中包含五个神经化学系统的普查分布.
• 新的Python工具可以量化细胞位置和纤维密度,生成多主体热图 (异构图和合构图).
• 该数据集与HY和ZI的现有空间数据一起注册,提供关键的空间定位信息.

结论:

• Chemopleth 1.0为大鼠下丘脑和不确定的区域中的神经化学系统提供了必要的空间定位信息.
• 这个数据库有助于基因导向的操作和转基因系的验证.
• 它为以社区为驱动的以地图库为基础的老鼠下丘脑化学架构空间模型建立了框架.