在子宫内膜异位症和复发性植入失败中解开共享的诊断基因和细胞微环境变化,通过多omics分析
Dongxu Qin1, Yongquan Zheng2, Libo Wang3
1Department of Pharmacy, Women's Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, 310006, China. qdxyxt@zju.edu.cn.
Scientific reports
|March 18, 2025
概括
研究人员确定了共享的诊断基因PDIA4和PGBD5,用于子宫内膜异位症 (EMs) 和复发性植入失败 (RIF). 这些在纤维细胞中发现的生物标志物为早期诊断和针对性治疗这些生殖医学疾病提供了潜力.
科学领域:
- 生殖医学 生殖医学
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 子宫内膜异位症 (EMs) 和复发性植入失败 (RIF) 是重叠病理生理学的显著生殖健康挑战.
- 目前关于EM和RIF之间共享的机制和诊断生物标志物的研究是有限的.
研究的目的:
- 通过使用集成的转录和单细胞测序数据,在EMS和RIF之间识别共享的诊断基因和细胞微环境变化.
- 验证早期诊断和有针对性的治疗策略的潜在生物标志物.
主要方法:
- 来自GEO数据库的转录组和单细胞测序数据的综合分析.
- 不同基因表达分析,WGCNA,随机森林和XGBoost用于基因识别和查.
- 单细胞测序,GSEA,ceRNA网络分析和ROC分析用于验证和机械洞察.
主要成果:
- 通过机器学习确定了16个关键基因,主要表达在纤维细胞中,PDIA4和PGBD5被选择为最佳的共享诊断生物标志物.
- 单细胞分析证实了正常和疾病状态之间的纤维细胞中PDIA4和PGBD5的差异表达.
- 对单个基因的ROC分析显示出强大的诊断性能 (AUC>0.7);M2巨细胞和涉及致病的γδT细胞.
结论:
- PDIA4和PGBD5是对子宫内膜异位症和复发性植入失败的有希望的共享诊断生物标志物.
- 研究结果揭示了涉及免疫反应,血管功能和激素调节的共同分子机制,为新的治疗点提供了潜力.
