启用,赋权,取得成功:生物信息学研讨会 利用开放的基于网络的工具监测细菌抗菌素耐药性
Luria Leslie Founou1,2,3,4, Opeyemi U Lawal5, Armando Djiyou6
1Reproductive, Maternal, Newborn and Child Health (ReMARCH) Research Unit, Research Institute of the Centre of Expertise and Biological Diagnostic of Cameroon (CEDBCAM-RI), Yaoundé, Cameroon. luriafounou@gmail.com.
BMC microbiology
|March 19, 2025
概括
这次研讨会成功地提高了对喀麦隆抗菌素耐药性 (AMR) 监测的生物信息技术技能. 当地研究人员获得了对基因组学数据分析的信心,这对于在资源有限的环境中对抗AMR至关重要.
科学领域:
- 基因组学和生物信息学
- 全球卫生安全 全球卫生安全
- 传染病监测 传染病监测 传染病
背景情况:
- 抗菌素耐药性 (AMR) 是一个关键的全球健康威胁,西撒哈拉以南非洲面临高死亡率.
- 基因组学研究对于了解和控制抗菌耐药性至关重要,但由于受影响地区的人力能力有限,实施受到阻碍.
- 在资源有限的环境中,对抗药物耐药性的现有监测和控制措施往往不足.
研究的目的:
- 概述一个生物信息学研讨会,旨在建立在喀麦隆的基因组学研究的人类能力.
- 支持使用可访问,用户友好的,基于网络的生物信息工具进行抗菌素耐药性监测.
- 解决在资源有限的环境中实施基因组学研究的挑战.
主要方法:
- 在喀麦隆进行了为期三天的生物信息学研讨会.
- 培训涵盖了下一代测序概念,细菌基因组学数据格式和数据共享.
- 参与者利用基于网络的生物信息学工具进行in silico AMR预测,遗传学分析和基本的 Linux 命令.
主要成果:
- 研讨会后观察到,参与者对生物信息学知识和技能的信心显著增加.
- 在研讨会之前,大多数参与者对识别测序技术 (64%) 和分析遗传数据 (81%) 缺乏信心.
- 在接受培训后,大多数人表示对使用NCBI BLAST等基于网络的工具进行数据分析的信心很高 (得分≥5).
结论:
- 这种培训方法有效地赋予了当地研究人员权力,并弥合了AMR基因组监测的生物信息学差距.
- 自由使用的基于网络的工具可以克服贫困地区的基础设施和资源限制.
- 建立生物信息学能力对于全球健康和可持续的抗抗药性制至关重要,特别是在资源有限的地区.
