无细胞DNA碎片化的动态分析揭示了食后代谢和免疫变化
Ziting Zhu1, Tao Chen2, Manting Zhang1
1Department of Laboratory Medicine, The Second Affiliated Hospital of Zhejiang University, Hangzhou, 310009, China.
Human genomics
|March 19, 2025
概括
饭后的状态显著改变了无细胞DNA (cfDNA) 碎片化模式. 这些cfDNA碎片组提供了对新陈代谢和免疫状态的见解,对于生物标志物评估至关重要.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 食物摄入会影响身体的平衡和循环的无细胞DNA (cfDNA).
- 追踪食后cfDNA来源和消除是具有挑战性的.
- 在液体活检中对食后变化的cfDNA碎片的有用性尚不清楚.
研究的目的:
- 为了研究食后状态对cfDNA碎片组学的影响.
- 探索DNA核酶在饭后cfDNA碎片化的作用.
- 为了对源估计的基因表达与cfDNA碎片化相关联.
主要方法:
- 从健康个体的禁食和食后状态下进行血cfDNA的全基因组浅层测序 (30分,2小时).
- 对cfDNA片段大小分布和末端动机的分析.
- 分碎指数与基因表达数据的相关性.
主要成果:
- 饭后状态显著改变了cfDNA片段大小分布,在30分钟时有更多的短片段,在2小时时有更多的长片段.
- 在餐后观察到DNASE1L3,DNASE1和DFFB活动的变化.
- 代谢和免疫反应基因的升级与相关细胞/组织的cfDNA贡献增加相关.
结论:
- 饭后状态显著影响cfDNA碎片化,在使用cfDNA作为生物标志物时需要考虑.
- cfDNA碎片化的特征显示出监测代谢和免疫状态变化的潜力.
