开发和验证使用免疫检查点相关基因在清细胞细胞癌的公共数据集中的预后和诊断模型
Bin Zhao1, Shi Fu2, Yuanlong Shi1
1Department of Urology, Peking University Cancer Hospital Yunnan, Yunnan Cancer Hospital, The Third Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, Yunnan, China.
Frontiers in genetics
|March 19, 2025
概括
这项研究开发了一种用于清细胞细胞癌 (ccRCC) 的预后模型,使用了四种与免疫检查点相关的基因 (ICRGs). 该模型提供了关于ccRCC预后和诊断的见解,有助于未来的治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 清细胞细胞癌 (ccRCC) 是最常见的癌亚型.
- 免疫检查点抑制剂对晚期ccRCC有效,但免疫检查点相关基因 (ICRG) 的作用尚未完全理解.
- 了解ICRG对于改善ccRCC诊断和预后至关重要.
研究的目的:
- 分析ccRCC中ICRG的表达模式和预后意义.
- 开发和验证基于ICRG的ccRCC的预后和诊断模型.
- 探索与ccRCC预后相关的潜在分子机制和免疫透.
主要方法:
- 利用来自TCGA,ICGC和GEO的大规模ccRCC数据集.
- 确定差异表达ICRG (DICRG) 和选择的预后基因.
- 开发了一个使用考克斯回归的预后模型,并用qRT-PCR和IHC验证了它.
- 使用机器学习构建诊断模型,并进行功能和免疫透分析.
主要成果:
- 确定了14个DICRG,其中EGFR,TRIB3,ZAP70和CD4具有预后意义.
- 在ccRCC组织中通过qRT-PCR验证了EGFR,TRIB3和CD4的增加表达.
- 开发了基于基因表达的预后风险评分.
- 功能分析显示有机离子运输和新陈代谢途径的丰富;免疫透分析显示与ZAP70和CD4相关.
结论:
- 建立了ccRCC使用四个关键ICRG的预后模型.
- 提供了关于ccRCC预后和诊断的分子机制的宝贵见解.
- 开发的模型可以帮助预测ccRCC患者的结果,并指导治疗决策.
关键词:
CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4 CD4欧洲农业基金会 (EGFR) 是一个基金.在Tribe3中,Tribe3是指Tribe3,Tribe3是指Tribe3.在ZAP7070中使用.清细胞细胞癌 (ccRCC) 是一种癌症.诊断 诊断 诊断 诊断 诊断 诊断与免疫检查点相关的基因预后 预后 预后
