在双斑蜘蛛,Tetranychus urticae (Acari:Tetranychidae) 的转录体中发现的阿尔法二病毒片段

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 关节动物病理学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 裸体病毒 (Nudiviridae家族) 是包裹的,双链DNA病毒感染昆虫和甲类动物.
• 它们作为农业和水产养殖中的生物控制剂和病原体具有重要意义.

研究的目的:

• 为了识别和表征一种来自双斑蜘蛛,Tetranychus urticae.的新型nudivirus.
• 确定这种新病毒的遗传学位置和基因组特征.

主要方法:

• 用RNA测序 (RNA-seq) 来识别虫转录组中的病毒序列.
• 进行了生物信息分析,包括基因组组装,ORF注释和核心基因的遗传学分析.
• 转录分析分析评估了基因表达水平.

主要成果:

• 发现了一种新型的努迪病毒的四个部分,称为Tetranychus urticae alphanudivirus (TuNV).
• 组装后的基因组包括100,780个基因组组和122个注释的ORF,包括所有28个保存的nudiviral核心基因.
• 遗传学分析将TuNV置于Alphanudivirus属内,与跳相关的努迪病毒一起. 观察到可变的转录活性和间隔的节肢动物基因同类物.

结论:

• 这项研究描述了来自Tetranychus urticae的新型阿尔法努迪病毒,扩大了已知的努迪病毒的多样性.
• 基因组和遗传学数据提供了对关节动物宿主内nudivirus进化的见解.
• 图恩病毒代表了对理解虫病毒与宿主相互作用的重要发现.