在人类血液中从全长单个B细胞转录组和匹配的型解析的生殖系组合中进行新型抗体鉴定

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 免疫球蛋白 (IG) 位点 (IGH,IGK,IGL) 是编码抗体成分的多态基因组区域.
• V(D) J重组和体质突变产生抗体多样性,但受到生殖线IG等位基因的限制.
• 生殖线IG类型和表达的抗体库之间的关系尚未完全理解.

研究的目的:

• 调查胚胎免疫球蛋白 (IG) 单体类型如何影响表达的抗体库.
• 在接种麻疹,疹和红疹 (MMR) 疫苗后,将生殖线IG位置序列与B细胞反应相关联.

主要方法:

• 来自捐赠者的生殖线IG位点的基因组测序.
• 单细胞转录组测序来自同一供体MMR疫苗接种后的B细胞.
• 组装IGH位点成一个完全分阶段的对抗,以解决母系和父系的等位基因.

主要成果:

• 胚胎线IGH基位被测序并组装,允许从父母染色体中完全分辨V,D和J谱.
• 单细胞转录组为重新排列的IG转录提供了整个转录组特征和准确的共识序列.
• 来自共识序列的合成抗体显示与麻疹抗原结合并中和麻疹病毒.

结论:

• 结合单细胞B细胞转录组的生殖线IG单型组序列,提供了对抗体谱系生成的全面视图.
• 这种方法可以识别特定的抗体反应,如针对麻疹的抗体,与个体生殖系遗传组成有关.
• 了解生殖线IG变异对于预测和潜在地设计对病原体的抗体反应至关重要.