肝量:基于特征的图像分析工具包,用于自动量化与代谢功能障碍相关的脂肪性肝病

科学领域:

• 数字病理学数字病理学
• 计算分析 计算分析
• 肝脏疾病量化定量化

背景情况:

• 肝活检的病理学家评估是诊断MASLD的黄金标准.
• 现有的自动化工具对整个幻灯片图像 (WSI) 缺乏适用性,并且通常是专有产品.
• 需要在WSIs中为MASLD提供开源,准确的量化工具.

研究的目的:

• 介绍Liver-Quant,这是一个开源的Python软件包,用于量化肝脏WSIs中的脂肪和纤维化.
• 开发一个可复制和可访问的工具,用于MASLD风险分层.
• 为了实现肝脏病理学的组织学特征的自动分析.

主要方法:

• 肝脏-量子利用颜色和形态特征来计算化比例面积 (SPA) 和原比例面积 (CPA).
• 该软件包在内部 (414个世界经济论文) 和外部 (109个世界经济论文) 数据集上进行了验证.
• 使用斯皮尔曼等级系数 (ρ) 评估了计算的SPA/CPA和病理学家得分之间的相关性.

主要成果:

• 对于肥胖症量化的实质性相关性 (ρ = 0.92),对于纤维化量化的中度相关性 (ρ = 0.51).
• 斑点正常化改善了Van Gieson,Picro Sirius Red和Masson的Trichrome斑点中CPA测量的一致性.
• 高分辨率图像 (0.25-0.50 MPP) 对于准确的SPA至关重要,而较低分辨率 (10 MPP) 则足以用于CPA.

结论:

• 肝脏量子提供了一个开源解决方案,用于在WSIs中快速准确地量化MASLD.
• 该工具可以适应各种组织学染色.
• 肝脏-Quant促进可复制和有效的肝脏病理分析,用于MASLD诊断和风险分层.