在无菌体液和组织中对负面mNGS报告的临床评估

科学领域:

• 临床微生物学 临床微生物学
• 传染性疾病 传染性疾病
• 基因组医学是一种基因组医学.

背景情况:

• 基因组学下一代测序 (mNGS) 越来越多地用于诊断感染.
• 关于阴性mNGS结果的临床实用性研究有限,特别是对于无菌体液.
• 围绕负面mNGS结果的方法论讨论强调了进一步临床验证的必要性.

研究的目的:

• 为了评估阴性mNGS结果的诊断准确性,我们排除了来自各种无菌体液的感染.
• 在临床实践中识别导致虚假阴性mNGS结果的因素.
• 评估采样时间对负面mNGS结果可靠性的影响.

主要方法:

• 追溯分析150个负的mNGS结果从怀疑无菌体液感染的患者.
• 将样品分为血,脑脊液 (CSF) 和其他组的分类.
• mNGS结果与最终实验室和临床诊断的相关性.
• 影响mNGS准确性的临床因素 (部门,症状,医生判断) 的分析.

主要成果:

• 血阴性mNGS显示出排除感染的最高诊断准确率 (72.0%).
• 大脑脊髓液 (CSF) 和其他样本组表现出高的虚假阴性率 (分别为59.6%和69.8%).
• 早些时候的mNGS测试症状出现后与更高的真负率相关.

结论:

• 负的mNGS结果,特别是来自血的结果,在临床上很有价值,可以排除感染.
• 在CSF和其他体液中高的假阴性率需要谨慎的解释.
• 患者因素,采样时间和临床判断对于优化mNGS诊断准确性至关重要.