通过整合信息学和实验验证的验证,TRAF2在胰腺癌中的作用被揭示出来

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 免疫学 免疫学 免疫学

背景情况:

• 瘤亡因子 (TNF) 受体关联因子-2 (TRAF2) 作为E3全方位联酶和脚手架蛋白质起作用.
• TRAF2有助于各种恶性瘤的进展.
• 在瘤微环境中的癌症表观遗传学,预后和免疫反应中,TRAF2的特定作用仍然在很大程度上未被定义.

研究的目的:

• 为了研究不同人类癌症中TRAF2的表达模式.
• 为了评估TRAF2表达的预后意义.
• 探索TRAF2与表观遗传改变,瘤微环境成分和免疫细胞透的关联.

主要方法:

• 利用人类蛋白质地图,TIMER 2.0和TCGA数据库进行表达分析.
• 使用cBioPortal和GSCA进行与突变和表观遗传学相关联.
• 进行了生存分析 (卡普兰-梅尔,考克斯回归) 和途径丰富分析 (LinkedOmics).
• 评估免疫细胞透和检查点基因相关性,使用TIMER 2.0和R.
• 在肝细胞癌中使用单细胞测序,免疫光和体外淘汰实验来研究TRAF2.

主要成果:

• 在各种癌症中,TRAF2经常发生突变和过度表达,与预后不佳相关.
• 在多种癌症类型中观察到涉及TRAF2的显著表观遗传变化.
• TRAF2的表达与免疫检查点基因和瘤透免疫细胞有关,这表明它在瘤微环境中发挥了作用.
• 丰富分析将TRAF2与T细胞激活联系起来;单细胞和体内数据证实了TRAF2在恶性细胞和T细胞中的过度表达,特别是在肝细胞癌中.
• 在体外研究表明,TRAF2倒置抑制肝细胞癌细胞恶性.

结论:

• 过度表达TRAF2与多种癌症的不良结果有关.
• TRAF2在调节瘤免疫微环境方面发挥作用.
• TRAF2成为癌症免疫疗法的有前途的预后生物标志物和治疗标,特别适用于肝细胞癌.