CyFidb:囊性纤维化的一个分子地图
Catarina Pereira1, Margarida D Amaral1, Andre O Falcao1
1BioISI-Biosystems Integrative Sciences Institute, Faculty of Sciences, University of Lisboa, Campo Grande, 1749-016 Lisboa, Portugal.
概括
囊性纤维化 (CF) 是一种由CFTR基因变异引起的遗传疾病. 一个新的数据库,CyFidb,整合了CF相关的数据,包括蛋白质相互作用和基因表达,以方便研究访问.
科学领域:
- 遗传学和分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 疾病研究 疾病研究
背景情况:
- 囊性纤维化 (CF) 是一种遗传性疾病,由CF跨膜导电调节器 (CFTR) 基因中的2,100多种变异引起.
- 在上皮细胞中,CFTR蛋白质作为阴离子通道起作用.
- 现有的CF相关数据在多个资源中分散,阻碍了全面分析.
研究的目的:
- 开发一个集中,可访问的资源,用于囊性纤维化研究.
- 将分散的CF相关信息整合到一个名为CyFidb.b的单个存储库中.
主要方法:
- 407个科学文章的手工策划.
- 包括对CFTR变异,各种疾病,药物治疗和细胞/组织类型的研究.
主要成果:
- CyFidb将信息组织成三个层次:蛋白质-蛋白质相互作用,基因表达和功能研究.
- 用户可以搜索并提取与CFTR变异及其生物背景相关的特定数据.
结论:
- CyFidb是一个开放式访问,不断更新的资源,用于策划的CFTR变异数据.
- 该平台旨在通过为CF提供统一的生物信息来源来简化研究.


