基于全基因组测序的人口遗传分析野生和家养子品种的遗传分析

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 人口遗传学 人口遗传学
• 动物科学动物科学

背景情况:

• 欧洲子 (Oryctolagus cuniculus) 包括野生种群和各种养品种.
• 密集的选择性繁殖导致了不同的形式和使用的子.
• 了解野生和养的欧洲子之间的遗传相互作用对于保护和繁殖计划至关重要.

研究的目的:

• 对野生欧洲子种群进行广泛的基于全基因组测序 (WGS) 的种群基因组学研究,并选择家养品种.
• 研究遗传多样性,种群结构,近亲繁殖和选择的特征.
• 识别与养相关的遗传变异和监管元素.

主要方法:

• 多个野生和养的欧洲子种群的全基因组测序 (WGS).
• 应用各种种群基因组学分析方法.
• 对遗传混合物,近亲繁殖水平 (同胞性运行),固定变异和选择特征的分析.

主要成果:

• 野生和养的欧洲子种群在遗传上是不同的,有证据表明法国和匈牙利种群的混合.
• 发现了跨种群的内生繁殖,其中一个匈牙利亚种群表现出过多的同卵性.
• 在国内和野生群体之间发现了许多固定的变异,其中包括两个固定在不同的等位基因. 假定选择的区域,一些跨基因,被丰富为转录因子结合位.

结论:

• 家庭和野生欧洲子保持着不同的遗传特征,但基因流动发生.
• 亲生繁殖和选择塑造了不同种群的基因组.
• 基因间区域和调节元素,特别是转录因子结合点,可能在子化中发挥了重要作用.
• 产生的高覆盖率基因组序列为未来的人口遗传学研究提供了宝贵的资源.