通过meta-omics研究的菌体-细菌相互作用是产生多基酸盐的混合微生物培养的基础动态

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 环境科学 环境科学
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 生产多基酸盐的混合微生物培养 (PHA-MMC) 对生物降解塑料合成至关重要,但它们的社区动态尚不清楚.
• 菌体在塑造PHA-MMC结构和功能中的作用在很大程度上是未被探索的,尽管建议参与社区转移.

研究的目的:

• 研究PHA-MMC中的菌体和细菌之间的相互作用.
• 阐明菌体对PHA-MMC结构内的动态变化的影响,并确定与PHA合成相关的菌体编码基因.

主要方法:

• 丰富了五个PHA-MMC和时间抽样.
• 结合了元基因组和元转录组分析来研究菌体与细菌之间的相互作用.
• 大基因组组合基因组 (MAG) 和菌体操作分类学单元 (pOTU) 的组合.
• 结构方程建模以分析社区动态.

主要成果:

• 在菌体和细菌群体之间观察到一致的动态变化.
• 菌体被证明可以化主导物种,促进的创造和社区的继承.
• 七个参与PHA合成的辅助代谢基因 (AMG) 在菌体序列上被确定,并确认被积极转录.
• 产生了PHA-MMC及其相关AMG中的菌体的第一个目录.

结论:

• 菌体在PHA-MMCs中调节细菌社区结构和动态方面发挥着至关重要的作用.
• 菌体可以作为与PHA合成相关的辅助代谢基因的载体,可能增强细菌的代谢能力.
• 菌体代表着一个重要的遗传储存库,影响细菌群落的功能特征,并为微生物群落控制提供潜在的工具.