基于可编程内核酶的黑色素瘤NRAS突变ctDNA的超敏感检测
Zuoying Zhang1, Qing Ji2, Zhanfang Zhang1
1Medical School, Faculty of Medicine, Tianjin University, Tianjin, 300072, China.
Cancer genetics
|March 28, 2025
概括
一种新的超敏感测定检测黑色素瘤NRAS突变循环瘤DNA (ctDNA) 在血液中. 这种方法为黑色素瘤提供了不那么侵入性的诊断工具,在患者样本中显示出高精度.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子诊断学 分子诊断学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 黑色素瘤是癌症死亡的一个重要原因.
- 在黑色素瘤中,NRAS突变很常见.
- 流通瘤DNA (ctDNA) 的液体活检提供了更少的侵入性诊断潜力.
研究的目的:
- 开发一种超灵敏的测试方法,用于检测黑色素瘤患者的NRAS突变ctDNA.
- 通过液体活检,使黑色素瘤的早期和准确诊断成为可能.
主要方法:
- 开发了NRAS PASEA试验,使用CRISPR-Cas蛋白向5'-TTN-3'PAM序列.
- 在异热放大过程中采用野生类型基因的连续剪切,用于指数突变基因放大.
- 利用桑格测序来检测突变ctDNA的可检测放大.
主要成果:
- 该NRAS PASEA测定检测到模拟ctDNA与突变的等位基因分数低至0.01%.
- 准确识别NRAS Q61R,Q61L和Q61K突变,包括PAM部位的"N"位置的变化.
- 在100%的测试黑色素瘤患者样本 (5/5),成功检测到NRAS突变ctDNA,没有假阳性.
结论:
- 在外周血液中检测ctDNA对于黑色素瘤管理至关重要,特别是在具有挑战性的成像场景中.
- 开发的试验证明了与瘤组织下一代测序 (NGS) 的100%一致性.
- 这种分析为伴随性诊断和监测黑色素瘤治疗反应和疾病进展提供了一种新的策略.
