自主监督的fMRI时间序列变压器的预训练任务在自闭症检测中
Yinchi Zhou1, Peiyu Duan1, Yuexi Du1
1Department of Biomedical Engineering, Yale University, New Haven, CT, USA.
概括
这项研究引入了一种新的基于变压器的框架,用于使用静止状态fMRI数据检测自闭症谱系障碍 (ASD). 自主监督的预培训与ROI掩盖显著提高了分类准确性,优于从头开始训练的模型.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 机器学习 机器学习
- 医疗成像医学成像
背景情况:
- 自闭症谱系障碍 (ASD) 由于症状的变化而带来诊断挑战.
- 休息状态功能磁共振成像 (rs-fMRI) 是研究ASD中大脑活动的关键工具.
- 变压器模型对分析复杂的序列数据 (如fMRI) 是有前途的.
研究的目的:
- 开发和评估基于变压器的自主监督学习框架,用于使用rs-fMRI数据进行ASD分类.
- 调查不同掩盖策略在自我监督的预训中提高模型性能的有效性.
- 为了解决小型神经成像数据集中常见的过度匹配问题.
主要方法:
- 开发了一个基于变压器的自我监督框架,直接分析rs-fMRI时间序列数据.
- 自主监督的预训包括重建随机掩盖的fMRI数据,策略包括掩盖整个ROI或时间点.
- 预训练模型为ASD分类进行了微调,并通过交叉验证在两个公共数据集上进行了验证.
主要成果:
- 在自我监督的预训练期间掩盖整个ROI,与掩盖时间点相比,产生了更高的性能.
- 这种ROI掩盖策略导致AUC平均提高10.8%,主题准确度平均提高9.3%.
- 与从头开始的培训相比,拟议的框架在不同数量的培训数据中表现得更好.
结论:
- 基于变压器的自主监督学习,特别是使用ROI掩盖,对于rs-fMRI的ASD分类是有效的.
- 开发的框架提供了一个有希望的方法来提高ASD的诊断准确性.
- 这项研究为研究界提供了一个有价值的,公开可用的资源.
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