在马来西亚出现B.1.617.2 (三角洲) 变种期间,SARS-CoV-2阳性样本中RT-PCR Ct值的下降

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 流行病学 流行病学
• 分子诊断学 分子诊断

背景情况:

• 反转录-聚合酶链反应 (RT-PCR) 周期值 (Ct) 值与病毒载荷成反比例.
• SARS-CoV-2 变种的出现,特别是 B.1.617.2 (三角形),显著影响了全球感染率.
• 马来西亚在2021年经历了大量的COVID-19急剧增长,与德尔塔变种的流行情况相吻合.

研究的目的:

• 分析Ct值与马来西亚SARS-CoV-2基因组变异相关的分布.
• 调查Ct值,病毒变异和COVID-19流行趋势之间的相关性.
• 评估Ct值分析对监测人口层面传播动态的有用性.

主要方法:

• 从2020年和2021年对阳性COVID-19样本的CT值分布的表格.
• 基因组测序用于识别SARS-CoV-2变种 (B.1.36,B.1.524,B.1.617.2). 基因组测序用于识别SARS-CoV-2变种 (B.1.36,B.1.524,B.1.617.2). 基因组测序用于识别SARS-CoV-2变种.
• 对Ct值趋势的统计分析和与国家COVID-19病例数据的比较.

主要成果:

• 从2020年到2021年,观察到中位数Ct值的显著下降 (p<0.01).
• 2021年的样本主要包括B.1.617.2变种,与2020年变种相比,该变种的中位数Ct值较低.
• 降低Ct值的趋势与马来西亚每周COVID-19病例的增加有关.

结论:

• CT值分布分析可以有效地表明人口层面的SARS-CoV-2传播动态.
• 该研究强调了B.1.617.2变种,较低的CT值和增加的COVID-19病例之间的联系.
• 将CT值分析与基因组测序相结合,有助于早期检测和控制新出现的SARS-CoV-2菌株.