通过UltraSelex的单步发现高亲和度RNA配体
Yaqing Zhang1,2, Yuan Jiang3, David Kuster4
1Institute of Pharmacy and Molecular Biotechnology (IPMB), Heidelberg University, Heidelberg, Germany. yaqing.zhang@uni-heidelberg.de.
Nature chemical biology
|March 31, 2025
概括
UltraSelex在一天左右的时间内快速发现RNA体,克服了传统方法的局限性. 这种新技术可用于活细胞成像和酶抑制,加速药物发现.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 亚胺是核酸配体,具有多种应用,包括治疗和诊断.
- 传统的体体发现 (SELEX) 是艰苦的,耗时的,可能会产生低于最佳的候选物.
- 需要更快,更有效的aptamer发现方法.
研究的目的:
- 开发一种快速的,非代的方法来发现高亲和度RNA吸收体.
- 为了证明新方法的实用性,用于识别针对不同目标的aptamers.
- 为了能够快速推断最小的aptamer图案.
主要方法:
- UltraSelex结合了生物化学分区,高通量测序和计算等级建模.
- 这种非代的方法简化了aptamer选择过程.
- 该方法在大约一天内实现了胺体的发现.
主要成果:
- UltraSelex成功地识别了针对罗达胺染料和两个蛋白质的高 afinity RNA 吸收体.
- 鉴定到的体使活细胞RNA成像和SARS-CoV-2RNA依赖RNA聚合酶和HIV逆转录酶的有效抑制成为可能.
- 从排序的序列中,可以很容易地推断出最小的体模因.
结论:
- 超级Selex提供了一个明显更快的替代传统的aptamer发现.
- 该方法加速了对候选药物和诊断工具的新型体的识别.
- 超级Selex促进了基于aptamer的技术的快速发展.


