在人体血的高度复合蛋白质组测定中和它们之间的相关性
Mary R Rooney1,2, Jingsha Chen1,2, Christie M Ballantyne3
1Department of Epidemiology, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, MD, United States.
Clinical chemistry
|April 2, 2025
概括
蛋白质学平台的精度有所不同. 索马Scan 11k显示了高精度,而Olink Explore HT则显示了高精度.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物标志物发现发现
- 临床检测 临床检测
背景情况:
- 蛋白质原子测试的数量正在迅速增加.
- 索马扫描和Olink是具有明显优势和局限性的领先平台.
- 缺乏对最新的 SomaScan 11k 和 Olink Explore HT 平台进行精确的比较.
研究的目的:
- 为了比较SomaScan 11k和Olink Explore HT蛋白质组学平台的精度.
- 评估跨平台协议的重叠蛋白质.
- 为研究平台的选择提供信息.
主要方法:
- 使用了来自102名社区动脉样硬化风险研究参与者的分割血样本.
- 用变化系数 (CV) 和斯皮尔曼相关性来测量试验精度.
- 对4443个重叠的蛋白质进行了评估.
主要成果:
- 索马Scan 11k显示高精度 (中位相关性为0.85,中位CV为6.8%).
- 奥林克探索HT的精度较低 (中位相关性为0.65,中位CV为35.7%),精度与检测极限 (LOD) 以上的样品相反.
- 调整奥林克LOD值提高了精度 (中位相关性为0.79,中位CV为13.3%),但跨平台相关性有显著差异.
结论:
- 蛋白质学平台的精度随着测试覆盖范围的增加而有所不同.
- 索马Scan 11k保持了高精度,而Olink Explore HT的精度已经下降.
- 根据具体的研究需求和测试性能,仔细选择平台至关重要.
