基于生物信息学分析的DM2和牙周炎的潜在诊断标志物和治疗目标
Rong Luo1, Zhenye Liang1, Huijun Chen1
1Department of Pharmacy, Taizhou First People's Hospital, Taizhou, China.
PloS one
|April 2, 2025
概括
这项研究确定了S100A9作为关键基因,将2型糖尿病和牙周炎联系起来. 通过TLR4信号通路,S100A9可能促进疾病的进展,提供潜在的诊断和治疗点.
科学领域:
- 基因组学和生物信息学
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 2型糖尿病 (DM2) 和牙周炎 (PD) 分享了一种复杂的双向关系.
- 底层DM2和PD相互作用的精确分子机制尚未完全理解.
研究的目的:
- 通过生物信息分析来调查DM2和PD之间的共享基因和共同的分子特征.
- 确定两种疾病的潜在诊断和治疗点.
主要方法:
- 从基因表达综合 (GEO) 数据库下载并分析基因表达数据集 (DM的 GSE6751,PD的 GSE15932).
- 鉴定了差异表达基因 (DEG) 并进行了丰富分析 (基因本体学,KEGG).
- 构建了一个蛋白质-蛋白质相互作用网络以识别枢纽基因 (ITGAM,H2BC21,S100A9) 并使用体外模型和分子分析 (qRT-PCR,Western blot) 验证了发现.
主要成果:
- 在DM2和PD之间确定了44种常见的DEG.
- ITGAM,H2BC21和S100A9被确定为具有诊断潜力的高调节的枢纽基因 (曲线下的面积>0.65).
- 在体外实验证实了在模拟的DM相关PD模型中增加S100A9表达和TLR4/p-NF-κB信号的激活.
结论:
- S100A9 是一个关键的枢纽基因,涉及DM2和PD的病变发生.
- 通过激活TLR4信号通路,S100A9可能会促进疾病的发展.
- 在DM2和PD的诊断和治疗中,S100A9是一个有前途的目标.


