对转录组进行比较分析,确定了与玉米内核行号相关的候选基因
Shukai Wang1, Yancui Wang1, Xitong Xu1
1College of Agronomy, Shandong Agricultural University, Taian, Shandong, China.
PeerJ
|April 4, 2025
概括
这项研究确定了11897个在玉米核中差异表达的基因. 参与发育和激素信号的关键候选基因被确定为未来的研究.
科学领域:
- 植物遗传学 植物遗传学
- 玉米育种 玉米育种 玉米育种
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 核心行号 (KRN) 是玉米影响作物产量的重要定量特征.
- 了解KRN的遗传基础对于玉米的改善至关重要.
- 到目前为止,已经确定了控制KRN的有限基因.
研究的目的:
- 为了确定控制玉米内核行号 (KRN) 的候选基因.
- 在玉米早期耳朵发育过程中分析转录组范围内的基因表达.
- 为阐明KRN分子机制提供遗传资源.
主要方法:
- 在五个发育阶段对两种对比的玉米杂交系的转录组分析.
- 差异基因表达分析以识别特定系的DEGs.
- 基因本体学丰富和QTL/QTN分析以确定候选基因.
主要成果:
- 在五个发育阶段检测到11,897个特定系的差异表达基因 (DEG).
- 基因表达模式被分为两个阶段 (V6-V8和V9-V10),具有不同的丰富路径.
- 92个高概率的候选基因,包括转录因子和与激素相关的基因,在QTL/QTN中被确定.
结论:
- 这项研究确定了调节玉米发展的关键候选基因.
- 与形态发生,分化和激素调节相关的转录途径在早期耳朵发育中至关重要.
- 为未来的基因克隆和玉米育种工作提供了宝贵的遗传资源.
更多相关视频
07:26Discrimintion and Mapping of the Primary and Processed Transcripts in Maize Mitochondrion Using a Circular RT-PCR-based Strategy
Published on: July 29, 2019
6.1K
07:18Obtaining High-Quality Transcriptome Data from Cereal Seeds by a Modified Method for Gene Expression Profiling
Published on: May 21, 2020
7.4K
