在单基分辨率下,小鼠早期胚胎的单细胞5-基甲基细胞素景观
Dongsheng Bai1, Jinmin Yang1, Xiaohui Xue2
1State Key Laboratory of Gene Function and Modulation Research, School of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, PRC.
Cell reports
|April 5, 2025
概括
这项研究使用schmC-CATCH在早期小鼠胚胎中绘制了DNA基甲基化图. 我们发现,十-十一转位 (TET) 介导的基甲基化在受精后就开始,在父母基因组上有不同的模式.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 发展生物学 发展生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 在哺乳动物早期胚胎发生过程中,DNA甲基化和基甲基化经历了显著的重编程.
- 了解这些修饰的调节作用需要高分辨率的DNA基甲基化图.
- 现有的方法可能缺乏解决方案或在早期发展中缺乏全面分析的范围.
研究的目的:
- 开发一种用于单细胞中定量,基准分辨率,全基因组DNA基甲基化映射的方法.
- 为了研究在小鼠体内和植入前胚胎中DNA基甲基化的动态.
- 为了确定十-十一转位 (TET) 介导的基甲基化过程的时间和模式.
主要方法:
- 开发单细胞5-基甲基细胞素 (5hmC) 的化学辅助C-to-T转换支持测序 (schmC-CATCH).
- 将schmC-CATCH应用于小鼠的雌性体和植入前胚胎 (胚胎从胚胎到胚胎).
- 在基底分辨率下对DNA基甲基化进行全基因组映射.
主要成果:
- 确定了TET介导的DNA基甲基化在受精后立即开始的过程,而不仅仅是在较晚的胚胎阶段.
- 揭示了父母基因组上明显的5hmC模式,受到TET3脱甲基酶的影响.
- 在早期胚胎中发现了与年轻的回归元和调节元相关的持久的5hmC热点.
结论:
- 在小鼠植入前开发过程中阐明了活性DNA脱甲基化的动态.
- 为早期胚胎提供了一个全面的DNA基甲基化景观.
- 为研究早期发育中的表观遗传重编程建立了有价值的资源.
