基于台湾人口的表观遗传钟及其应用于长期暴露于空气污染的应用
Ching-Chun Huang1, Shih-Chun Pan2, Pau-Chung Chen3
1Environmental and Occupational Medicine, College of Medicine, National Taiwan University and National Taiwan University Hospital, Taipei, Taiwan; Environmental and Occupational Medicine, National Taiwan University Hospital Hsin-Chu Branch, Hsin-Chu, Taiwan.
这项研究为台湾成年人开发了新的表观遗传钟,发现空气污染,特别是PM2.5和臭氧,加速生物衰老. 这些发现凸显了清洁空气的必要性,以促进亚洲人口健康老龄化.
科学领域:
- 表观遗传学和衰老的研究
- 环境流行病学环境流行病学
- 人口特定的生物标志物
背景情况:
- 现有的表观遗传时钟主要是在欧洲/西班牙裔群体中开发的,这限制了它们对不同人群的适用性.
- 特定种群的表观遗传模型对于准确评估亚洲群体的生物衰老及其决定因素至关重要.
- 长期暴露于空气污染是影响生物衰老的潜在环境因素.
研究的目的:
- 利用台湾生物库数据,开发针对台湾人口量身定制的新型表观遗传钟.
- 调查长期暴露于环境空气污染物和表观遗传衰老加速 (EAA) 之间的关联.
- 评估PM2.5和臭氧对亚洲群体生物衰老的影响.
主要方法:
- 开发了台湾表观遗传钟 (TWBAge,TWBhAge),使用对2469名参与者的血清DNA甲基化数据的惩罚性弹性净回归.
- 估计表观遗传年龄加速 (EAA) 度量,包括基于TWB的 (TWBEAA,TWBhEAA) 和已建立的时钟 (DNAmEAA,DNAmSBEAA,PhenoEAA,GrimEAA).
- 评估空气污染暴露 (PM2.5,O3) 使用空间插值,并使用多重线性回归和贝叶斯内核机器回归 (BKMR) 分析EAA的关联.
主要成果:
- 开发的TWBAge和TWBhAge模型准确地预测了时间年龄 (R2 = 0.95).
- 暴露于PM2.5与增加的TWBhEAA和DNAmEAA显著相关.
- 臭氧 (O3) 暴露与DNAmSBEAA呈阳性关联,与GrimEAA呈阴性关联,由BKMR证实.
结论:
- 这项研究介绍了为亚洲人群开发的第一个表观遗传钟,证明了高预测准确度.
- 长期暴露于PM2.5和臭氧对台湾队列的表观遗传衰老加速有显著的贡献.
- 调查结果强调了空气污染减缓战略对于促进健康老龄化和减少健康差异的重要性.
更多相关视频
08:48Analysis of the Ambient Particulate Matter-induced Chromosomal Aberrations Using an In Vitro System
Published on: December 21, 2016
12:15Quantification of three DNA Lesions by Mass Spectrometry and Assessment of Their Levels in Tissues of Mice Exposed to Ambient Fine Particulate Matter
Published on: May 29, 2019
相关概念视频
01:46Epigenetic Regulation
01:47Lung Capacity