高通量蛋白质标映射可以加速对ToxCast和PFAS化合物的生物活性发现
Diwen Yang1,2, Xiaoyun Wang1, Jiabao Liu1,3
1Department of Chemistry, University of Toronto, Toronto, ON, Canada.
bioRxiv : the preprint server for biology
|April 8, 2025
概括
这项研究使用质谱法来发现化学污染物的新蛋白质标. 脂肪酸结合蛋白 (FABPs) 结合到和多基基物质 (PFAS),而新的PFAS显示了更广泛的结合.
科学领域:
- 环境化学环境化学
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 化学污染构成全球健康风险,但毒性机制往往是未知的.
- 识别蛋白质标对于理解化学毒性和风险评估至关重要.
研究的目的:
- 使用超高通量亲和力选择质谱 (AS-MS) 平台系统识别优先级化学污染物的蛋白质标.
- 调查和多基基物质 (PFAS) 与脂肪酸结合蛋白 (FABP) 的结合模式.
主要方法:
- 应用了超高通量亲和选择质谱 (AS-MS) 平台,对50种人类蛋白质进行了对481种化学物质的选.
- 使用生物化学试验和X射线晶体学验证了与脂肪酸结合蛋白 (FABPs) 的相互作用.
- 评估了24,050种潜在的蛋白质化学相互作用.
主要成果:
- 发现了35种涉及14种蛋白质的新型相互作用,确定了FABP是高度可结合的.
- 发现了不同的PFAS结合模式:传统的PFAS选择性地与FABP1结合,而新的 perfluoroalkyl ethers carboxylic acid (PFECA) 则与所有测试的FABP结合.
- X射线结晶学表明,替代PFAS中的以太基增强了FABP结合的分子灵活性.
结论:
- 该AS-MS平台是有效的发现新型蛋白质目标超越现有的程序,如ToxCast.
- 替代PFAS表现出比传统PFAS更广泛的蛋白质结合谱,引发了人们对其作为令人遗憾的替代品的潜力的担忧.
- 了解这些相互作用对于评估与新出现的化学污染物相关的健康风险至关重要.
更多相关视频
08:31Biosensor-based High Throughput Biopanning and Bioinformatics Analysis Strategy for the Global Validation of Drug-protein Interactions
Published on: December 1, 2020
4.9K
16:02Demonstration of the Sequence Alignment to Predict Across Species Susceptibility Tool for Rapid Assessment of Protein Conservation
Published on: February 10, 2023
2.6K
