准确的DNA甲基化预测C9orf72在致病范围中的重复扩张等位基因

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 遗传学 是一个遗传学.
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.

背景情况:

• C9orf72 六核酸重复扩张是前性痴呆症 (FTD) 和肌性侧面硬化症 (ALS) 的主要遗传原因.
• 准确识别携带者对于了解疾病机制和开发向疗法至关重要.

研究的目的:

• 开发和验证一种基于DNA甲基化 (DNAm) 的预测器,用于识别C9orf72重复扩张载体.
• 为了评估C9orf72重复扩张载体在大型队列中的流行率.

主要方法:

• 在FTD队列 (27名携带者,250名非携带者) 上使用EPICv2阵列进行全基因组DNA甲基化分析.
• 开发一个DNAm最小绝对收缩和选择运算符 (LASSO) 模型来预测重复扩张状态.
• 在一个由2548名受试者组成的独立队列中验证LASSO预测因子.

主要成果:

• 在C9orf72位点的8个CpG位点显示载体中显著的差异性高甲基化.
• DNAm LASSO模型在预测C9orf72重复扩张状态时实现了98.6%的准确性.
• 该预测器在一个独立的队列中确定了四个以前未知的载体,表明更高的流行率.

结论:

• 对C9orf72重复扩张载体的高度精确的DNA甲基化生物标志物被确定.
• 这种表观遗传方法为研究C9orf72相关的神经退行性疾病提供了有价值的工具.
• 这些发现支持了表观遗传流行病学在重复扩散疾病的大规模研究中的潜力.