长时间阅读,多安普利康测序来探索与粉降解表型相关的遗传多样性在粉溶性乳酸菌中
Sandra A Olivier1,2, Michelle K Bull1,2, John P Bowman1
1Agriculture and Food Systems, Tasmanian Institute of Agriculture University of Tasmania, Hobart, TAS, Australia.
Frontiers in microbiology
|April 10, 2025
概括
研究人员开发了一个框架来评估粉降解的乳酸菌及其酶. 这种方法确定了各种物种的氨基溶解潜力,有助于工业应用和富含粉资源的生物转化.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 酶学 是一种酶学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 粉降解乳酸菌对于生产有价值的副产品和可持续的粉丰富资源的生物转化至关重要.
- 利用它们的酶活性是新型食品应用和工业过程的关键.
研究的目的:
- 开发和验证一种方法和分析框架,以评估Lactobacillaceae.的粉降解潜力.
- 在选定的乳酸菌种中表征氨溶性活性和相关的遗传元素.
主要方法:
- 现象分析使用适应的粉亚格板与多种粉来源来评估细胞外粉分解活性.
- 使用多片测序 (MinIONTM) 进行基因组分析,以识别粉降解相关的基因.
- 对已识别的基因和推断的氨基酸进行序列分析,以推断酶的功能.
主要成果:
- 乳酸菌群的分离物表现出较弱至中度的氨解活性,不同类型的粉的水解有所不同.
- 一种强大的生粉降解剂,L. amylovorus NRRL B4540,显示出完全的水解,归因于amyA和假定的pullulanase (Pul).
- 假设的pullulanase被假设为必要的粉降解在其他分离物中,可能作为一个amyllopullulanase或需要补充酶.
结论:
- 开发的框架有效地描述了乳杆菌家族的氨溶性潜力.
- 像amyA和pullulanase这样的特定酶在粉水解中起着关键作用,有可能发现新的酶.
- 该框架可用于分析微生物组和选不同种群中的其他功能.
