使用分子条形码精确的血统追踪表明,在线虫中对ivermectin耐药性的健身权衡

科学领域:

• 进化遗传学的进化遗传学
• 动物模型系统动物模型系统
• 抗类药物耐药性 抗类药物耐药性

背景情况:

• 环境因素极大地影响了基因的选择.
• 高通量条形码血统追踪对于测量选择至关重要,但在动物中具有挑战性.
• 以前的方法是有限的,主要是微生物系统.

研究的目的:

• 在动物模型中实施第一个随机基因组条码健身实验,使用TARDIS系统在Caenorhabditis elegans.
• 精确测量ivermectin度对ivermectin耐药性选择强度的影响.
• 调查与ivermectin耐药性相关的健康权衡.

主要方法:

• 利用TARDIS条形码系统在C. elegans.中进行随机基因组整合.
• 暴露在不同度的甲虫药物ivermectin的人群中.
• 随着时间的推移,使用深度测序来估计血统适应性的量化条形码频率.

主要成果:

• 在低度的ivermectin中表现出显著的耐药性成本,耐药性突变物被野生类型超越了竞争.
• 当ivermectin度超过2nM时,观察到选择偏向耐药基因型的转变.
• 确定了耐药性和阻碍耐药个体发展速度之间的可能权衡.

结论:

• C. elegans 是一个适合用于高通量条形码的模型,以估计适应性.
• 这种方法为药物耐药性和经济重要特征的演变提供了新的见解.
• 环境条件精确地调节了对特定遗传特征的选择强度.