评估衰老的转录组特征:测试mRNA标记面板用于法医估计血液样本的年龄
Nadescha Viviane Hänggi1, Jacqueline Neubauer1, Yael Marti1
1Zurich Institute of Forensic Medicine, University of Zurich, Zurich, Switzerland.
Forensic science international. Genetics
|April 10, 2025
概括
通过RNA表达来估计犯罪者的年龄是一个有前途的法医工具. 虽然有针对性的测试显示了潜在的可能性,但显著的变异使得从血液样本中准确预测年龄变得复杂.
科学领域:
- 法医科学 法医科学 法医科学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 在法医调查中,估计未知个人的年龄至关重要.
- 表观遗传修饰通常用于年龄估计,但RNA表达模式提供了一个互补的分子方法.
- 之前的研究发现了508个与年龄相关表达相关的mRNA标记.
研究的目的:
- 开发和评估针对性RNA测序试验,用于法医年龄预测.
- 为了比较规范化方法和回归技术,以优化年龄估计的准确性.
- 评估使用RNA表达特征来从血液样本中确定时间年龄的可行性.
主要方法:
- 设计了一个有针对性的大规模并行测序 (MPS) 试验,使用508个先前识别的mRNA标记.
- 该试验使用来自23-73岁的献血者100个血液样本进行了评估.
- 我们比较了三种规范化方法和各种回归技术,包括弹性净回归与dSVA规范化数据.
主要成果:
- 性能最好的模型 (带dSVA正常化的弹性净回归) 实现了9.29年的平均绝对误差 (MAE).
- 在时间和预测年龄之间观察到0.57的相关性.
- 尽管采用了有针对性的方法,但在目标测序数据中发现了显著的不良变化.
结论:
- 向RNA测序为法医应用提供了优势,但在数据变化方面面临着挑战.
- 基于RNA表达模式的准确年龄预测仍然很困难,因为固有的生物和技术噪音.
- 需要进一步的研究来完善基于RNA的年龄估计方法,以便可靠的法医使用.
