确定与猪生殖功能相关的候选基因和eQTL
Tong Zeng1, Ji Wang1, Zhexi Liu1,2
1National Engineering Laboratory for Animal Breeding, Department of Animal Genetics and Breeding, College of Animal Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100193, China.
Animals : an open access journal from MDPI
|April 12, 2025
概括
这项研究确定了调节母猪子宫内膜基因表达的基因变异 (eQTLs),以改善生殖. 这些发现为提高母猪生育能力和繁殖策略提供了分子标记.
科学领域:
- 基因组学和动物育种
- 分子生物学分子生物学
- 生殖生物学 生殖生物学
背景情况:
- 表达量的特征位点 (eQTL) 映射识别了影响基因表达的遗传变异.
- 与农场动物复杂特征相关的SNP通常是eQTL.
- 了解子宫内膜eQTL对于解开母猪生殖功能和遗传改进至关重要.
研究的目的:
- 确定调节猪子宫内膜基因表达的遗传变异.
- 发现用于改善母猪生育和繁殖的分子标记物.
- 阐明母猪生殖特征的遗传基础.
主要方法:
- 对218个猪子宫内膜的RNA-seq数据进行eQTL分析.
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 以确定枢纽基因.
- 结合eQTL和WGCNA的结果,可以精确确定候选基因和eQTLs.
主要成果:
- 确定了34876个重要的调节5632个基因的cis-eQTLs.
- 通过WGCNA发现了90个与生殖功能相关的枢纽基因.
- 确定了14个候选基因和16个精细映射的cis-eQTL,包括FRK,ARMC3和SLC35F3,通过激素调节,细胞粘附和新陈代谢参与繁殖.
结论:
- 已识别的eQTLs调节子宫内膜中的候选基因表达,影响母猪的生殖功能.
- 这些发现加深了对母猪生殖特征的遗传基础的理解.
- 已识别的eQTL作为标记辅助选择 (MAS) 的有价值的遗传标记,以提高母猪的生育能力和繁殖策略.


