在瘤相关的巨细胞中,使用CUT&RUN测定来研究基因组乳酸化素的基因组概况的协议
Alessandra De Leo1, Alessio Ugolini1, Filippo Veglia2
1Wistar Institute, Philadelphia, PA 19104, USA; Department of Immunology, H. Lee Moffitt Cancer Center, Tampa, FL, USA.
STAR protocols
|April 12, 2025
概括
这项研究详细介绍了一项分析素乳糖化,一种表观遗传调节剂的协议,在瘤相关的巨细胞中. 该方法使用CUT&RUN测试来对全基因组的基因素乳化进行分析.
科学领域:
- 表观遗传学和分子生物学
- 癌症研究 癌症研究
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 氨酸乳酸化是一种关键的组织蛋白修饰,影响基因转录和表观遗传调节.
- 了解免疫细胞,特别是与瘤相关的巨细胞中的乳化模式,对于癌症研究至关重要.
研究的目的:
- 介绍一个详细的协议,以调查基因组的基因组概况的基因组乳酸化.
- 建立一种使用CUT&RUN试验分析瘤相关巨细胞中的乳化分析方法.
主要方法:
- 该协议涉及准备活细胞并使用光激活细胞分类 (FACS) 来分离特定的巨细胞群 (GLUT1+ MDM).
- 它包括与乳糖特异性抗体结合抗体的步骤,以及通过定量PCR (qPCR) 进行DNA量化.
- 该方法在瘤衍生和体外生成的骨髓衍生巨细胞中得到了验证.
主要成果:
- 这项研究提供了一种可重复的协议,用于全基因组的基因素乳化映射.
- 证明了对特定巨细胞子集的成功隔离以及随后对乳糖化标记的分析.
结论:
- 这一协议使得在瘤相关的巨细胞中详细研究基因素乳化.
- 该方法为癌症免疫学中的表观遗传研究提供了有价值的工具.
