基于机器学习的克罗恩病相关生物标志物和泛癌分析的识别
Tangyu Yuan1, Jiayin Xing1, Pengtao Liu2
1School of Life Science and Technology, Shandong Second Medical University, Weifang, Shandong, China.
Mediators of inflammation
|April 14, 2025
概括
新型生物标志物S100P和S100A8显示出对诊断克罗恩病 (CD) 的前景. S100P还与肝癌和肺癌的免疫细胞透和存活有关,这表明炎症和癌症之间有共同的途径.
科学领域:
- 生物标志物发现发现
- 基因组学就是基因组学.
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- 全球克罗恩病 (CD) 发病率的增加.
- 确立了CD和癌症风险增加之间的相关性.
- 需要新的CD诊断生物标志物.
研究的目的:
- 确定克罗恩病的新型诊断生物标志物.
- 调查已识别的生物标志物的泛癌相关性.
- 探索CD炎症与癌症发展之间的联系.
主要方法:
- 来自GEO数据库的基因表达特征分析.
- 机器学习管道 (LASSO,神经网络,SVM-RFE) 用于生物标志物选择.
- 使用独立数据集和泛癌分析 (UCSC数据库) 进行验证.
主要成果:
- S100结合蛋白P (S100P) 和S100结合蛋白A8 (S100A8) 被确定为关键的CD生物标志物.
- 在独立数据集中验证的S100P与免疫细胞透和肝癌和肺癌中的存活有关.
- 研究结果表明,CD中的慢性炎症有助于癌症风险.
结论:
- S100P和S100A8是克罗恩病的潜在诊断生物标志物.
- 在泛癌分析中,S100P具有更广泛的临床相关性,特别是在肝癌和肺癌中.
- 研究为了解炎症性疾病和癌症的共享途径提供了基础.
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