在肺腺癌中进行激光辅助微切割和tRF和tiRNA测序的协议
Zi Wang1,2, Qinglin Wang1,2, Lin Xu1,2
1Department of Thoracic Surgery, Jiangsu Cancer Hospital, Jiangsu Institute of Cancer Research, Nanjing Medical University Affiliated Cancer Hospital, Nanjing, China.
Bio-protocol
|April 14, 2025
概括
本研究详细介绍了一种使用激光辅助微解剖 (LAM) 来分离高风险肺腺癌 (LUAD) 细胞的方法. 目标是识别转移RNA衍生碎片 (tRF) 和tRNA衍生应激诱导RNA (tiRNA) 作为潜在的LUAD生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 肺腺癌 (LUAD) 呈现出显著的细胞异质性,使诊断和治疗复杂化.
- 在LUAD中微毛囊/固体 (MIP/SOL) 模式与患者预后不佳有关.
- 转移RNA衍生的片段 (tRFs) 和tRNA衍生的压力诱导RNAs (tiRNAs) 越来越多地被认为是癌症发展的关键调节者.
研究的目的:
- 建立一个协议,以使用激光辅助微解剖 (LAM) 来隔离特定的高风险LUAD细胞群体.
- 在这些隔离细胞内分析tRF和tiRNA,以确定LUAD的潜在诊断和治疗生物标志物.
- 调查tRF-Val-CAC-024和tiRNA-Gly-CCC在LUAD中的作用.
主要方法:
- 激光辅助微解剖 (LAM) 用于精确隔离具有MIP/SOL模式的LUAD组织.
- 组织固定和微粒切割用于细胞制备.
- RNA提取,库准备和下一代测序用于tRF和tiRNA分析.
主要成果:
- 使用LAM成功分离了特定的高风险LUAD细胞种群.
- 生成高质量的转录基因数据,包括tRF和tiRNA资料.
- 确定tRF-Val-CAC-024和tiRNA-Gly-CCC作为潜在的生物标志物.
结论:
- 该LAM协议有效地隔离特定的LUAD细胞群,用于分子分析.
- tRFs和tiRNAs,特别是tRF-Val-CAC-024和tiRNA-Gly-CCC,作为LUAD早期诊断和治疗目标的生物标志物具有前途.
- 这种方法有助于更深入地了解LUAD异质性和分子机制.
