通过虚拟查,对接和分子动态模拟来识别针对Mycobacterium abscessus InhA的新型抑制剂
Munawar Abbas1, Abdullah R Alanzi2, Kashif Iqbal Sahibzada3,4
1College of Food Science and Technology, Henan University of Technology, Zhengzhou, 450001, Henan, China.
Scientific reports
|April 14, 2025
概括
使用计算方法确定了针对Mycobacterium abscessus enoyl acyl载体蛋白减少酶InhA的新药候选者. 这些潜在的抑制剂为治疗由M. abscessus引起的耐药肺部疾病提供了希望.
科学领域:
- 药用化学 医学化学
- 计算生物学 计算生物学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 由Mycobacterium (MAB-PD) 引起的肺部疾病由于耐药性和效率差,治疗选择有限.
- MAB 乙烯基载体蛋白 (ACP) 降解酶 InhA (MAB-InhA) 对于酸生物合成至关重要,是有前途的药物标.
研究的目的:
- 通过基于结构的虚拟查和分子模拟来确定用于MAB-PD治疗的新型MAB-InhA抑制剂.
- 评估已识别的化合物对MAB-InhA.的潜在疗效和稳定性.
主要方法:
- 使用Glide对接使用Enamine抗菌库 (32,000个化合物) 的基于结构的虚拟选.
- 基于分子力学的一般化出生表面积 (MM/GBSA) 和吸收,分布,新陈代谢和分泌 (ADME) 预测.
- 200 ns的分子动力学 (MD) 模拟,以评估顶级命中者的稳定性和相互作用 (Z4,Z5,Z6) 与MAB-InhA.
主要成果:
- 根据对接分数和相位分析,确定了六种潜在的MAB-InhA抑制剂 (Z1-Z6).
- MD模拟证实了MAB-InhA活性部位内的Z4,Z5和Z6的稳定性和有利的相互作用.
- 对RMSD,RMSF和配体-蛋白相互作用的分析支持了这些化合物的潜力.
结论:
- 已识别的化合物 (Z4,Z5,Z6) 是有前途的分子,可用于开发抗M. abscessus感染的新药.
- 计算方法在发现新型抑制剂时是有效的,用于挑战MAB-InhA等药物标.
