整合肺部和全身转录基因资料,以描述儿科血造干细胞移植后的肺损伤

科学领域:

• 血液学 血液学 血液学
• 肺部病理学 肺部病理学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 造血干细胞移植 (HCT) 可以导致肺损伤.
• 支气管支气管洗 (BAL) 是侵入性的,并且很难进行连续监测.
• 作为HCT患者肺部采样的替代品,外周血液尚未得到证实.

研究的目的:

• 为了确定外周血液转录组是否可以作为小儿HCT患者肺部采样的最小侵入性替代品.
• 为了比较BAL和外周血液转录组,了解HCT后的肺损伤.

主要方法:

• 对比了来自166名儿科HCT患者的210个配对的BAL和外周血液转录组.
• 分析了基因表达,基因组,细胞部分和T/B细胞受体克隆类型.
• 整合配对的转录组以识别患者子组和生存关联.

主要成果:

• 对于单个基因,基因组或细胞部分,BAL和血液mRNA丰富度之间发现了最小的相关性.
• 确定了不同的转录程序:BAL显示免疫,上皮-介质细胞过渡和缺氧通路;血液显示内皮损伤,DNA修复和代谢通路.
• 配对转录组集成确定了患有不同缺氧率和结果的患者组,其中一组的结果明显较差.

结论:

• BAL和外周血液转录组为HCT后的肺损伤机制提供了独特的,细分的见解.
• 周围血液不能完全取代BAL进行肺评估,但提供了补充的系统信息.
• 两部分的转录造型分析有助于理解和潜在地管理HCT后的肺损伤.