关于NMR代谢学最佳实践:当前状态
Robert Powers1, Erik R Andersson2, Amanda L Bayless3
1Department of Chemistry, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, NE 68588-0304, USA Nebraska Center for Integrated Biomolecular Communication, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, NE 68588-0304, USA.
核磁共振代谢学研究往往缺乏必要的细节和标准化的报告. 本次调查强调了在进行和报告这些科学研究方面需要最佳实践.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分析化学 分析化学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 核磁共振 (NMR) 代谢学是研究生物系统的强大工具.
- 对NMR代谢学研究的标准化报告对于可重复性和数据解释至关重要.
- 之前的评估表明,有关代谢学实验的报告存在差异.
研究的目的:
- 调查当前进行和报告NMR代谢学研究的实践.
- 发现报告实验基本细节和统计方法的漏洞.
- 鼓励开发和采用该领域的最佳实践.
主要方法:
- 从PubMed.Med.来源,对2020年的463篇论文和2010年的80篇论文进行文献调查.
- 研究人员手动分析选定的论文,以评估报告的实验程序和协议的完整性.
- 评估统计方法和模型验证实践.
主要成果:
- 许多研究报告的实验细节和统计方法不完全.
- 监督多变量统计分析的不正确应用和缺乏验证是常见的.
- 协议和软件的高度多样性表明缺乏共识和标准化的做法.
结论:
- 目前的NMR代谢学研究在方法和报告方面表现出相当大的异质性.
- 对于NMR代谢学界来说,迫切需要建立和遵守共同的标准.
- 采用最佳实践将提高代谢学数据的可靠性和可比性.
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