在CKD中循环FGF23,HRG-HMGB1和心脏病的网络相互作用
Farzana Perwad1, Elvis A Akwo2, Arushi Singhal3
1University of California San Francisco, San Francisco, CA.
对GWAS (MTAG) 的多特征分析确定了纤维细胞生长因子23 (FGF23) 的新型遗传位点. 功能性基因组学揭示了胺丰富的糖蛋白 (HRG) 和高流动性组盒1 (HMGB1) 作为慢性病 (CKD) 的关键调节剂.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 基因组学就是基因组学.
- 生物化学 生化学
背景情况:
- 全基因组关联研究 (GWAS) 已经确定了矿物代谢标记者的遗传位置,但主要使用单一特征分析.
- 矿物代谢特征之间的重叠遗传架构在识别新兴关联方面仍未得到充分探索.
研究的目的:
- 为了对矿物代谢标志物进行GWAS (MTAG) 的多特征分析.
- 通过探索共享的遗传影响来确定纤维细胞生长因子23 (FGF23) 的新型遗传关联.
主要方法:
- 将MTAG应用于来自GWAS的五种遗传相关的矿物代谢标志物的常见变异. 在欧洲祖先参与者中.
- 综合英国生物银行和CHARGE GWAS对酸盐,25-氧维生素D,,副甲状腺激素和FGF23.23的数据.
- 利用深度机器学习来监督和无监督地识别与FGF23.23相关的遗传特征.
主要成果:
- MTAG将FGF23的有效样本大小增加到n=50,325,确定了62个独立的全基因组显著位点,许多以前没有报告.
- 功能性基因组学确定了富含histidine的糖蛋白 (HRG) 和高流动性组盒1 (HMGB1) 作为FGF23通路的主调节器,在心脏组织中丰富.
- DNMT3A与尿液毒素相关,并且在心力衰竭患者的体中显示出保护作用.
结论:
- 通过利用多特征相关性,MTAG分析显著提高了FGF23全基因组显著位置的发现.
- 功能基因组学揭示了新的调节网络,突出了HRG-HMGB1作为FGF23和慢性病 (CKD) 中心血管疾病的关键调节器.
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