实现公众健康风险评估的透明毒动力学建模
Sarah E Davidson-Fritz1, Caroline L Ring2, Marina V Evans2
1Center for Computational Toxicology and Exposure, Office of Research and Development, United States Environmental Protection Agency, Cincinnati, Ohio, United States of America.
PloS one
|April 16, 2025
概括
该httk R包可用于缺乏体内数据的化学物质的毒动力学建模. 它允许从体外研究中推断,以预测人类健康风险,帮助公共卫生评估.
科学领域:
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 计算生物学 计算生物学
- 环境健康 环境健康
背景情况:
- 毒动力学建模对于理解体内化学物质的吸收,分布,新陈代谢和排泄 (ADME) 是至关重要的.
- 对于许多商业化学品,体内毒动力学数据很少,这阻碍了公共卫生风险评估.
- 新方法方法 (NAMs) 生成体外数据,可以推断来预测体外人类健康结果.
研究的目的:
- 描述将新的高通量毒动力学 (HTTK) 模型集成到开源httk R包中.
- 展示如何使用httk包来利用现有数据和功能来进行毒动力学建模.
- 为有毒动力学,生物信息学和公共卫生风险评估提供透明的开源工具.
主要方法:
- 使用了httk R包,该包包含了通用的毒动力学模型和化学特异性HTTK数据库.
- 采用MCSim,一种开源语言,用于描述在httk.com内基于生理学的毒动力学 (PBTK) 模型.
- 集成新的HTTK模型使用模型描述代码文件 (C脚本) 和模型文档文件 (R脚本).
主要成果:
- 提供了详细的说明,为httk包添加新的HTTK模型.
- 演示了气体吸入PBTK模型的集成,作为一个实际的例子.
- 该httk包支持模型参数化,使用体内数据进行评估,通过蒙特卡洛模拟传播不确定性,以及单位转换.
结论:
- 该httk R包提供了一个全面的开源平台,用于毒动力学建模和公共卫生风险评估.
- 方便使用体外数据和NAM来预测体内化学行为和对人类健康的影响.
- 通过为超过一千种化学品提供数据和工具,赋予研究人员和风险评估人员权力.
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