通过加权相关联网络分析和机器学习来识别和验证肺腺癌的与克罗化相关的诊断标记
Bowen Hu1, Xin Chen1, Dan Zou1
1Department of Oncology, The Affiliated Cancer Hospital of Nanjing Medical University, Jiangsu Cancer Hospital, Jiangsu Institute of Cancer Research, Nanjing, China.
Translational lung cancer research
|April 18, 2025
概括
这项研究确定了与结相关的基因,包括MMACHC,作为肺腺癌 (LUAD) 的潜在生物标志物. 这些基因与不良预后和免疫透有关,为LUAD提供了新的治疗和诊断点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 后翻译修改 后翻译修改
背景情况:
- 肺腺癌 (LUAD) 是全球癌症相关死亡的主要原因.
- 翻译后的修改,如克罗化,越来越多地被认为是它们在疾病发病过程中的作用.
- 在LUAD进展和瘤微环境中,crotonylation的具体参与仍然在很大程度上未被探索.
研究的目的:
- 为了确定关键的基因与crotonylation和预后在LUAD相关.
- 阐明这些基因在LUAD微环境中的作用.
- 探索这些基因作为LUAD治疗临床点的潜力.
主要方法:
- 利用来自TCGA和GTEx的RNA测序数据来识别与LUAD中的十字化相关的差异表达基因 (DEGs).
- 使用权重基因相关联网络分析 (WGCNA) 和蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 分析来识别枢纽基因.
- 通过Kaplan-Meier图表评估预后值,并通过TIMER和其他算法分析免疫细胞透. 在临床样本中验证的发现.
主要成果:
- 在LUAD中确定了GAPDH,SLC25A13,MMACHC和HDAC1作为潜在的化相关生物标志物.
- 这些基因在LUAD中过度表达,与预后不佳相关,并与免疫细胞透和炎症途径相关.
- 镇压MMACHC抑制了LUAD细胞的增殖和迁移,诱导了亡,并增强了免疫治疗的疗效.
结论:
- 与克罗化相关的基因,特别是MMACHC,代表了LUAD的有前途的新疗法标.
- 这些基因也可能作为肺腺癌的有价值的诊断标记.
- 对克罗托尼化通路的进一步研究可以显著推进LUAD临床管理.
