通过深度学习预测不确定性感知细分质量的贝叶斯模型:关于皮肤癌和肝脏细分的全面评估和解释
Sikha O K1, Meritxell Riera-Marín2, Adrian Galdran1
1BCN Medtech, Department of Engineering, Universitat Pompeu Fabra, Barcelona, Spain.
概括
这项研究引入了一个新的框架来预测生物医学图像细分质量,而无需手动注释. 它使用贝叶斯模型的不确定性图来可靠地评估临床环境中的细分精度.
科学领域:
- 计算生物医学图像分析.
- 机器学习用于医学成像.
- 深度学习中的不确定性量化.
背景情况:
- 图像细分在生物医学分析中至关重要,但在没有基本真相的情况下,很难在临床环境中进行评估.
- 现有的模型缺乏可靠性指标,阻碍了临床采用.
- 在没有手动注释的情况下评估细分质量是一个重大挑战.
研究的目的:
- 开发一种用于预测图像分割质量的新框架,而无需在测试时进行基准真理注释.
- 引入在细分模型中量化不确定性的方法.
- 为临床应用提供细分质量的可靠指标.
主要方法:
- 提出了两个互补的框架:一个是使用预测细分和不确定性地图,另一个是整合输入图像,不确定性和预测细分.
- 采用SwinUNet和特征金字塔网络的贝叶斯适应,使用蒙特卡洛丢弃,合并和测试时间增大.
- 在2D皮肤病变和3D肝脏数据集上评估了四个不确定性估计 (信任图,,相互信息,KL分歧).
主要成果:
- 在HAM10000数据集上获得R2=93.25和Pearson相关性=96.58,表现优于之前的方法.
- 证明了R2=85.03和Pearson相关性=65.02的交叉模式稳定性,用于使用测试时间增大与的3D肝脏细分.
- 开发了一个聚合策略,将多个不确定性估计结合起来,以获得更强大的质量评分.
结论:
- 拟议的不确定性意识框架可靠地预测分段质量,没有基本真相,解决临床部署的关键差距.
- 贝叶斯深度学习适应有效量化细分质量评估的不确定性.
- 该框架为模型可靠性提供了可解释的见解,促进了对临床实践的信任和采用.
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