使用高通量PCR系统对废水中的各种病原病毒进行季节性监测,并比较两种度方法
Prunelle Waldman1, Audrey Fraisse1, Mai-Lan Tran2
1Université Paris-Est, Anses, Laboratory for Food Safety, Enteric Viruses Unit, 14 rue Pierre et Marie Curie, 94701 Maisons-Alfort Cedex, France.
The Science of the total environment
|April 18, 2025
概括
使用高通量qPCR的废水病毒监测检测到30种病毒,显示季节性模式. 与用于公共卫生监测的沉方法相比,超离心法改善了病毒恢复.
科学领域:
- 环境病毒学环境病毒学
- 公共卫生监督是对公共卫生的监督.
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 废水分析是监测病原病毒在人群中的关键工具.
- 目前的废水病毒学分析方法缺乏标准化.
- 病毒病原体经常流入污水系统.
研究的目的:
- 开发一种高通量定量PCR (qPCR) 系统,用于在废水中检测30种人类病毒.
- 为了比较超离心和氧化沉用于病毒恢复.
- 评估巴黎废水中病毒的发生率和季节性变化.
主要方法:
- 为30种肠道和呼吸道病毒开发高通量qPCR阵列.
- 在2023年从巴黎收集流入和流出废水样本.
- 超离心和氧化吸附-沉对病毒度的比较.
主要成果:
- 超离心法产生显著更高的病毒恢复 (4.95-100%) 比沉 (0.77-33%),特别是在废水样本.
- 该qPCR阵列检测到许多致病病毒.
- 观察到病毒发生的明显季节性变化,特别是呼吸道病毒.
结论:
- 开发的高通量qPCR系统能够快速,灵敏和特定地检测废水中的多种病毒.
- 超离心是一种更有效的度方法,用于废水病毒学分析.
- 废水监测揭示了病毒病原体的显著季节性动态.
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