使用基于AAV9的大规模并行报告员测定来评估小鼠心脏中的调节元素的协议
Kaiyu Wang1, Meng Meng2, Minghong Leng2
1Department of Pharmacology, Joint Laboratory of Guangdong-Hong Kong Universities for Vascular Homeostasis and Diseases, School of Medicine, Southern University of Science and Technology, Shenzhen 518055, Guangdong Province, China; Guangdong Cardiovascular Institute, Guangdong Provincial People's Hospital, Guangdong Academy of Medical Sciences, Guangzhou 510080, China.
STAR protocols
|April 19, 2025
概括
这项研究引入了一种新方法,使用腺相关病毒血清型9 (AAV9) 和大规模并行报告测试 (MPRA) 来测量小鼠心中的调节元素活性. 该协议有助于在体内量化增强剂的功能.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 心血管生物学 心血管生物学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 哺乳动物的基因组有数千个对刺激敏感的调节元件.
- 了解这些元素对于破译心脏功能中的基因调节至关重要.
研究的目的:
- 提出一种评估小鼠心脏系统中调节元件功能的方案.
- 通过一种新的MPRA方法,使增强剂活性能够在体内定量.
主要方法:
- 使用基于腺相关病毒9型血清型 (AAV9) 的大规模并行报告员测试 (MPRA).
- 描述增强剂候选人选择,MPRA图书馆建设和动物交付的步骤.
- 详细测序库生成和数据分析管道用于体内研究.
主要成果:
- 开发的协议提供了一个全面的工作流程,用于增强器活动评估.
- 该方法允许对心脏中的调节元件功能进行定量分析.
结论:
- 这种AAV9-MPRA协议为研究心脏调节元素提供了一个强大的方法.
- 工作流程有助于更深入地了解哺乳动物心脏中的基因调节.
