使用群体层面的基因组信息模拟乳牛交配计划的长期影响
C Bengtsson1, H Stålhammar2, J R Thomasen3
1VikingGenetics, VikingGenetics Sweden AB, 53294 Skara, Sweden; Dept. of Animal Biosciences, Swedish University of Agricultural Sciences, Box 7023, 75007 Uppsala, Sweden.
Animal : an international journal of animal bioscience
|April 19, 2025
概括
使用经济分数的基因组交配分配有效地减少了近亲繁殖和遗传缺陷风险,同时保持了遗传收益. 优化公牛的使用平衡了快速的民意调查等位基因增长与近亲繁殖和缺陷载体频率管理.
科学领域:
- 动物育种与遗传学
- 量化遗传学 量化遗传学
- 人口遗传学 人口遗传学
背景情况:
- 基因定型为先进的育种计划提供单核酸多态性 (SNP) 数据.
- 综合各种因素的经济分数可以优化商业群体的交配分配.
- 了解基因组数据对交配的长期影响对于可持续的牲畜改善至关重要.
研究的目的:
- 探索基因组交配分配对繁殖目标的长期影响.
- 评估经济评分的有效性,包括遗传优点,特征,缺陷和关系.
- 评估基因组选择程序中的风险管理策略.
主要方法:
- 使用随机模拟建模来分析交配策略.
- 经济分数是通过结合遗传水平,民意调查,遗传缺陷和关系 (基因组和血统) 来开发的.
- 线性编程用于商业群体级别的交配分配.
主要成果:
- 将基因组或血统关系整合到经济得分中,可以降低近亲繁殖率,对遗传收益的影响最小.
- 包括衰退性遗传缺陷成本在内的得分几乎消除了缺陷表达.
- 对被调查性赋予经济价值 (≥50欧元) 会使被调查性等位基因的频率提高到每代高达0.037.
- 基因组关系在管理近亲繁殖方面与血统关系一样有效.
- 将每头公牛/一群的雌性数量限制在5%降低了近亲繁殖和遗传缺陷携带者频率变化.
- 每公牛10%的雌性限制加速了被调查的等位基因增加,但增加了近亲繁殖的风险.
结论:
- 基因组交配分配,以全面的经济分数为指导,在管理内生育和遗传缺陷方面提供了显著的优势.
- 为了实现可持续的育种计划,必须平衡对所需特征的选择 (例如,受访性) 与近亲繁殖和缺陷控制.
- 群体层面的基因组交配决定需要仔细考虑快速特征进步和遗传多样性保护之间的权衡.
