自动样本准备用于通过质谱测量对基质子转化后修饰的无偏分析

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 分子生物学分子生物学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.

背景情况:

• 基斯蛋白是染色质结构和功能的关键.
• 基因组上的翻译后修饰 (PTM) 调节基因转录和DNA过程.
• 质谱学对于量化众多的质子PTMs至关重要.

研究的目的:

• 描述一项用于无偏向的质子PTM分析的协议.
• 实施机器人液体处理以提高吞吐量.
• 为了提高一致性并减少样品准备中的手动步骤.

主要方法:

• 使用机器人液体处理器来准备素样本.
• 开发了一种用于自动化质子衍生和消化的脚本.
• 采用质谱法进行基因素PTMs的定量分析.

主要成果:

• 自动化协议减少了在素制备过程中的手工劳动.
• 实施机器人辅助可以提高质谱数据的一致性.
• 在大型样本队列中促进对基因素PTM的高通量分析.

结论:

• 描述的协议使得能够有效和一致地分析基因组PTMs.
• 自动化有利于大规模的蛋白质组学研究,涉及基因素修饰.
• 这种方法支持用于各种生物研究的基因组PTMs的无偏量化.