通过机器学习和多omics分析确定PSIP1作为骨髓瘤中的关键R循环调节器

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• R环的失调与癌症的发展和瘤免疫微环境 (TME) 有关.
• 在骨髓瘤 (OS) 发病过程中R环的具体作用尚不清楚.
• 了解R循环的参与对于开发OS的新疗法策略至关重要.

研究的目的:

• 开发基于R循环相关基因的骨肉瘤预后模型.
• 调查R环基因表达与OS中的瘤免疫微环境 (TME) 之间的关联.
• 确定影响OS进展的关键R-循环相关基因并验证它们的功能作用.

主要方法:

• 使用RNA测序 (RNA-seq) 数据构建一个R循环基因预测得分模型 (RGPSM).
• 分析RGPSM得分与TME特征之间的相关性.
• 使用单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 来识别OS进展中的关键R循环基因,然后进行体外和体外实验验证.
• 研究PC4和SRSF1相互作用蛋白1 (PSIP1) 在R循环动态和DNA损伤中的作用.

主要成果:

• 高RGPSM得分与较差的预后,较低的Huvos等级和在骨肉瘤患者中更抑制的TME有关.
• 在高RGPSM得分的患者中观察到更高比例的恶性细胞.
• 确定PC4和SRSF1相互作用蛋白1 (PSIP1) 在生殖性OS细胞中表达高,与预后不佳有关.
• PSIP1的淘汰抑制了OS的进展,增加了R循环积累和DNA损伤,而PSIP1的过度表达促进了R循环分辨率.

结论:

• 开发的RGPSM是预测骨髓瘤患者结果的宝贵工具.
• 通过调节R循环积累和DNA损伤,PSIP1在骨髓瘤进展中发挥着关键作用.
• 针对PSIP1可能是骨髓瘤的潜在治疗策略.