单细胞转录组分析确定了耐药的MDSC和耐压性基因共同表达网络作为多种疾病环境中常见的MDSC特征
Tianmeng Chen1, Julia Hughes1, Alyssa Gregory1
1Department of Surgery, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA, United States.
Frontiers in immunology
|April 23, 2025
概括
研究人员在耐压性髓状原型抑制细胞 (MDSC) 中发现了一种特定的基因模块. 这种分子特征有助于对MDSC进行分类,并揭示了癌症免疫中的细胞弹性.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 细胞生物学 细胞生物学
- 文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.
背景情况:
- 骨髓衍生抑制细胞 (MDSCs) 是一个多样化的免疫抑制细胞组,在免疫调节中至关重要.
- 确定MDSCs的通用分子特征对于在不同组织中准确分类至关重要.
研究的目的:
- 使用单细胞RNA测序来描述单细胞MDSC (M-MDSC) 内的异质性.
- 确定MDSCs的共同分子特征,特别是在炎症和细胞应激条件下.
主要方法:
- 由GM-CSF和IL-6诱导的人类MDSCs的单细胞RNA测序 (scRNA-seq).
- 在细胞因子治疗期间,通过血清饥饿增加细胞应激.
- 分析独立的批量和单细胞转录组数据集以进行验证.
主要成果:
- 鉴定出一种独特的抗压MDSCs (rMDSCs) 集群,其特征是特定的基因协同表达模块 (黄色模块).
- 含有耐压基因的黄色模块有效地将M-MDSC与对照细胞区分开来 (ROC AUC = 0.954).
- 这种rMDSC签名在人类癌症数据集中被发现,在免疫抑制性瘤C1Q巨细胞中表达高.
结论:
- 炎症和细胞应激协同塑造M-MDSC特征,强调细胞弹性的作用.
- 识别的耐压基因特征为MDSC分类和理解它们在癌症中的功能提供了强大的标记.
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